В моём понимании среда и субстанция это одно и тоже
С точки зрения концепции эфира любое поле (в том числе электромагнитные волны) - это разновидности возмущений (изменений) среды-носителя этих полей (эфира). То есть концепция эфира лишает поле самостоятельной субстанциональности.
Концепция физического вакуума, напротив, настаивает на самостоятельной субстанциональности полей, указывает на ненужность для них носителя.