Смотря как разгоняться и тормозить.
Если разгон-мгновенный (по отношению к продолжительности полета - скажем пару дней) и торможение мгновенное, то время в пути (навылет или с торможением) будет отличаться слабо. Если же разгон и торможение-медленное (Ну скажем ионником - месяцы.... годы. То как возрастет продолжительность полета навылет (уже будет под 1000-2000 суток) Так и с торможением. Надо считать для конкретного случая.
По уму-еще вес топлива учитывать. Чтобы затормозить тоже потребуется. А значит надо в случае торможения взять его побольше. С учетом резкого ухудшения соотношения (вес пустого КА/вес КА с топливом) получить прирост скорости в 100 км/ч при том, что у нас остается более 50% изначальной массы-ох как непросто. Реальность варианта с торможением и его характеристик-под большим-большим вопросом.